O uso da ABA voltada para o autismo baseia-se nos seguintes passos:
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Avaliação Inicial
Avaliação cuidadosa e aprofundada para determinar as competências que a criança possui e as que estão ausentes.
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Definição dos objetivos
A definição é feita baseada na avaliação inicial, no currículo base e na sequência de aquisição de competências em todos os domínios.
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Elaboração de programas
Vários procedimentos analítico-comportamentais são usados para reforçar competências existentes e construir as não existentes.
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Ensino intensivo
É dada muita ênfase em tornar o ensino agradável e envolver a criança numa interação social positiva.
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Avaliação do progresso
Ao final de casa sessão, o aplicador deve registrar o que foi feito e as respostas da pessoa, para que o progresso possa ser contabilizado.